Fakultas Ilmu Keperawatan merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana Menyelenggarakan pendidikan keperawatan yang Islami, unggul dibidang kegawatdaruratan dan berbasis teknologi informasi serta peka terhadap masalah kesehatan di masyarakat
Fakultas Sains dan teknologi merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana menyelenggarakan pembelajaran secara profesional dan inovatif dengan menerapkan model pembelajaran aktif berbasis teknologi informasi serta mengedepankan pendekatan akhlak Islami dan Kemuhamadiyahan.
Fakultas Farmasi merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana menyelenggarakan pendidikan farmasi yang unggul, berkarakter islami dengan berbasis IPTEKS dan kewirausahaan.Menghasilkan lulusan sarjana farmasi yang memiliki karakter islami dan berjiwa kewirausahaan sehingga mampu bersaing secara nasional.
Fakultas Psikologi marupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana menyelenggarakan proses pendidikan dan pengajaran di bidang psikologi berlandaskan nilai-nilai islam yang berbasis teknologi informasi.
Fakutas Hukum merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana Menyelenggarakan proses pendidikan dan pengajaran hukum dibidang industri berbasis teknologi informasi yang unggul serta dilandasi nilai-nilai keislaman
Fakultas Ekonomi Bisnis dan Politik merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana menyelenggarakan program pendidikan akuntansi, manajemen, dan ilmu politik tingkat sarjana yang berbudi luhur, berbasis teknologi informasi, dan berwawasan global serta adaptif terhadap perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi.
Fakultas Kesahatan Masyarakat merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana Menyelenggarakan pendidikan kesehatan masayarakat yang islami berbasis teknologi informasi yang peka terhadap kesehatan di Masyarakat.
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur memiliki visi pada tahun 2037 menjadi Lembaga Pendidikan Tenaga Kependidikan (LPTK) unggulan yang menghasilkan tenaga pendidik profesional dan berkepribadian Islami berbasis teknologi informasi serta mampu berkontribusi terhadap masalah sosial dan lingkungan.
Fakultas Pertanian dan Bisnis Digital merupakan salah satu fakultas yang ada di UMKT yang dimana Menyelenggarakan pendidikan kesehatan masayarakat yang islami berbasis teknologi informasi yang peka terhadap kesehatan di Masyarakat.
